1993年，时任厦门市政协主席蔡望怀召集社会各界有识之士，创办厦门市第一所民办大学——私立厦门鹭岛大学（后更名为“私立厦门华厦大学”）。
   创办初期，学校以租借校舍方式办学。1993-1995年租借厦门嘉滨小学校舍；1995-1997年租借厦门一中“五三”楼。
   1995年10月,经厦门市委教育工委批准,建立中共厦门私立华厦大学支部委员会，是厦门市最早建立党支部委员会的民办高校。
   1997年，学校入迁曾厝垵校区，拥有产权校舍23008平方米（总占地面积110亩），进入了全面发展的办学新时期。同年，学校被全国民办高等教育委员会授予“全国民办高校先进单位”。
   2001年，经福建省人民政府批准、教育部备案，成为国家计划内统招的高等职业院校，并正式更名为“厦门华厦职业学院”。
   2003年4月，经厦门市委教育工委批准，学院党支部升格为中共厦门华厦职业学院总支部委员会。同年，学院党总支被厦门市委教育工委授予“先进基层党组织”的称号。
   2007年8月，经厦门市委组织部批准，建立中共厦门华厦职业学院委员会，并于2009年被厦门市委教育工委授予“教育系统基层党建工作示范点”。
   2007年10月，学院顺利通过教育部高职高专人才培养工作水平评估，成为厦门市首家通过国家评估的民办高职院校。
   2008年，学院进驻位于集美文教区的新校区（总占地面积390亩，总建筑面积146236平方米），开启加速发展的办学新阶段。
   2010年成为《非营利性民办高校办学制度改革试点项目》试点院校单位。